T/ZNZ 287-2024 瓜菜作物中抗生素抗性基因检测 高通量荧光定量PCR 法

ICS 13.080.30
CCS B 30
浙江省农产品质量安全学会团体标准
T/ZNZ 287—2024
瓜菜作物中抗生素抗性基因检测高通量荧光定量PCR 法
High-throughput quantitative PCR method for detection of antibioticresistance genes in gourd and vegetable crops
2024-08-28 发布2024-09-28 实施
浙江省农产品质量安全学会发布

前言
本文件按照GB/T 1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规则起
草。
请注意本文件的某些内容有可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本文件由浙江省农产品质量安全学会提出并归口。
本文件起草单位：中国科学院城市环境研究所、浙江大学、北京农业生物技术研究中心。
本文件主要起草人：苏建强、安新丽、周昕原、何艳、王旭明。
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1
瓜菜作物中抗生素抗性基因检测高通量荧光定量PCR 法
1 范围
本文件规定了瓜菜作物中抗生素抗性基因的高通量荧光定量PCR测定方法。
本文件适用于瓜果和蔬菜中抗生素抗性基因的检测。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，
仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本
文件。
GB/T 37874 核酸提取纯化方法评价通则指标参数
GB/T 40170 质粒抽提及检测通则抽提方法
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
抗生素抗性基因antibiotic resistance genes
使细菌对抗生素产生抗性的基因。
3.2
高通量荧光定量PCR high-throughput quantitative polymerase chain reaction，HT-qPCR
基于微孔芯片进行高通量、纳升级别的实时定量PCR方法。
3.3
可移动遗传元件mobile genetic elements
在基因组中可扩散或转移的遗传元件，如质粒、噬菌体、整合子、插入序列和整合接合元件等。
3.4
Ct值cycle threshold
每个反应体系中荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。
3.5
基因拷贝数gene copy number
某一种基因或某一段特定的DNA序列在单倍体基因组中出现的数目。
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2
4 原理
采用纳升级多样品自动加样器将样品分配到微孔芯片上，并通过高通量荧光定量PCR仪收集荧光信
号，根据获得的Ct值进行定量。
5 主要设备和仪器
5.1 高通量荧光定量PCR 仪
5.2 冷冻离心机
5.3 涡旋仪
5.4 核酸定量仪
5.5 多样品纳升分配器
5.6 荧光成像系统
6 主要试剂和材料
6.1 高通量荧光定量芯片
6.2 384 方孔板
6.3 封板膜
6.4 平底96 孔板
6.5 SYBR Green I Master
6.6 牛血清白蛋白溶液：50 mg/mL
6.7 超纯水
6.8 加样槽
6.9 无菌磷酸缓冲液
6.10 抗生素抗性基因引物
6.11 次氯酸钠溶液：有效氯终浓度0.2%
6.12 TE 缓冲液：pH 8.0
6.13 双链DNA 超敏检测试剂盒
6.14 DNA 纯化试剂盒
6.15 质粒提取试剂盒
6.16 载体连接试剂盒
6.17 无菌微孔滤膜0.22 μm
7 测定步骤
7.1 样品采集
绿叶菜类作物样品的采集：选取新鲜成熟的绿叶农作物种类，随机选取5株长势一致的农作物，在
同一高度采用无菌剪刀剪取5 g叶片放入无菌自封袋中，避光4℃冰箱保存6 h内备用。
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3
茄果类作物样品的采集：选取新鲜成熟的茄果类农作物种类，随机选取3个，采用无菌切刀切取1 g
放入无菌离心管中，避光4℃冰箱保存6 h内备用。
7.2 DNA 制备
将叶片样品剪碎后置于250 mL三角瓶中，加入100 mL无菌磷酸缓冲液，超声5 min；放置于摇床中，
室温、180 rpm提取1 h后，然后用无菌纱布过滤去除样品中植物组织，再用无菌微孔滤膜过滤，收集叶
际微生物，用于DNA提取。
果实样品切碎后置于15 mL离心管中，加入15 mL无菌磷酸缓冲液，超声5 min；放置于摇床中，室
温、180 rpm提取1 h，然后用无菌纱布过滤去除植物组织，再用无菌微孔滤膜过滤，收集茄果微生物，
用于DNA提取。
DNA样品的质量应符合GB/T 37874的质量指标要求。样品DNA浓度范围应为20 ng/μL -40 ng/μL，
对浓度大于40 ng/μL的样品应用超纯水进行稀释。
7.3 质粒样品的制备
7.3.1 PCR 扩增
对DNA 样品进行16S rRNA 基因的PCR 扩增。
7.3.2 DNA 纯化
用凝胶电泳对PCR 反应物进行分离，应用荧光成像系统检测扩增的DNA 片段。应用切胶刀精确切
割出目标DNA 片段。应用DNA 纯化试剂盒，对回收的DNA 片段进行纯化处理。
7.3.3 连接载体
应用载体连接试剂盒，将纯化后的DNA 片段连接到pMD19-T 载体上进行连接反应。
7.3.4 转化培养和Blast 比对
将连接好的DNA 载体转化到大肠杆菌中，在含有氨苄西林的培养基中培养。
从培养皿中挑选单个菌落进行测序，获得DNA 序列信息。
应用Blast 软件将测序结果与参考数据库进行比对，确认16S rRNA 基因的存在和序列的正确性。
7.3.5 质粒提取
根据GB/T 40170 要求，应用质粒提取试剂盒，从大肠杆菌中提取质粒DNA。
7.3.6 质粒浓度测定
宜用双链DNA 超敏检测试剂盒测定提取的质粒DNA 的浓度，通过稀释确保质粒拷贝数宜为1010
copies/μL。
7.4 标准曲线的制作
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4
将质粒标准液进行梯度稀释，获得不同基因拷贝数（范围宜为102~108 copies/μL）的标准液。使用
这些标准液进行PCR反应，以基因拷贝数的对数作为横坐标，Ct值作为纵坐标作图，并获得标准曲线。
制备标准曲线时需设置至少5个浓度点，每个浓度应至少做3个平行重复。
7.5 实验对照的设立
实验设立以下对照：
1）阳性对照，为质粒标准分子DNA；
2）阴性对照，相应的无抗生素抗性基因瓜菜样品DNA；
3）空白对照，设两个，一是提取DNA时设置的提取空白对照（以超纯水代替样品），二是PCR反
应的空白对照（以超纯水代替DNA模板）。
7.6 高通量荧光定量PCR 反应体系的制备
7.6.1 抗生素抗性基因引物和DNA 样品的分配
使用多样品纳升分配器，将附录A中的抗生素抗性基因引物、DNA样品和阳性克隆质粒分配到纳米
芯片上。
7.6.2 PCR 反应液I 的制备
将1870 μL SYBR Green I Master和1122 μL无菌水混合形成PCR反应液I。
7.6.3 引物的加载
在无酶孔板上，为每个孔加载9.6 μL PCR反应液I和2.4 μL抗生素抗性基因引物，共计120孔。
将引物从孔板分样到纳米芯片上。
7.6.4 PCR 反应液II 的制备
将640 μL SYBR Green I Master和361 μL无菌水混合，制备成PCR反应液II。
7.6.5 DNA 样品的加载
在无酶孔板上，为每个孔加载12.9 μL PCR反应液II和3.2 μL DNA样品，共计42孔。每个样品应
进行3个技术重复。
将DNA样品从孔板分样到已加载引物的芯片上。
7.6.6 离心和备用
引物和DNA样品分配完成后，宜用离心机将芯片在3200 rpm下离心5min。
离心完成后，应在芯片上贴膜以备后续使用。
7.7 高通量荧光定量PCR 程序
7.7.1 PCR 扩增程序
初始预变性步骤：95 ℃，10 min。循环步骤：95 ℃变性30 s，60 ℃退火延伸30 s，共40个循环。
7.7.2 熔解曲线分析
程序结束后自动升温，进行熔解曲线分析，检测PCR产物的特异性。
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5
7.8 高通量定量仪器运行操作步骤
7.8.1 多样品纳米分配器操作步骤
7.8.1.1 仪器检查和准备
气瓶气体含量应大于0.3 mpa，曝气水瓶应装满超纯水。更换次氯酸钠溶液，使有效氯终浓度达到
0.2%。保持40 psi 压力进行30 min 曝气。
7.8.1.2 仪器喷样
将384引物板和样品板喷到高通量荧光定量芯片上。离心机3500 rpm，4 ℃，离心10 min备用。
7.8.2 热循环仪操作步骤
7.8.2.1 仪器检查和准备
气瓶总压力应不低于100 psi，运行时压力维持在120 psi。
7.8.2.2 运行仪器
设置PCR程序和放置芯片。监控压力状态和荧光信号。
7.9 结果计算与表述
7.9.1 质量控制
下述指标有一项不符合者，需重新进行高通量荧光定量PCR扩增：
1）扩增效率应在80%-120%之间，且阴性对照和空白对照均无扩增。
2）标准质粒最低稀释浓度宜为2 copies/ng DNA，高通量定量过程中，根据质粒最低浓度测定的
Ct 值作为检测的最低检测限，最低定量浓度宜为20 copies/ng DNA。
3）抗生素抗性基因三个技术重复中，至少有两个为阳性才判定为有效扩增。
7.9.2 定性
定性分析的结果将按以下方式标示：若PCR反应未能检测到目标抗生素抗性基因，则结果记为“未
检出”；若PCR反应能够检测到目标基因，并且满足设定的质量控制标准，则结果记为“检出”。
7.9.3 定量
按照创建的标准曲线，使用下列公式计算瓜果和蔬菜样品中的相应抗生素抗性基因拷贝数，单位为
copies/每克瓜果作物。
C = 6.02 × 1023 × c/MW ……………… (1)
式中：
C——抗性基因丰度，单位为拷贝数每克（copies/g）；
MW——平均分子量，单位为克每摩尔（g/mol）；
c——样品中的DNA 浓度，单位为微克每克（μ/g）；
6.02×1023——阿伏伽德罗常数，单位是拷贝数每摩尔（copies/mol）
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6
AA
附录A
（规范性）
瓜菜作物中抗生素抗性基因信息
瓜菜作物中抗性基因种类、基因类别及引物序列见表A.1。
表A.1 瓜菜作用中抗性基因种类、基因类别及引物序列
抗性基因名
称
抗生素类
别
前引物（5’-3’） 后引物（5’-3’）
23s
-Enterococci
物种分类AGAAATTCCAAACGAACTTG CAGTGCTCTACCTCCATCATT
aac(3)-ib 氨基糖苷
类
ACGTTCTGCCAAAGTTTGAG ACTGCCGGATCGTCAC
aac(3)-id_i
e
氨基糖苷
类
CAGCGAGACGTTCATCGC CACGCTTCAGGTGGCTAATC
aac(3)-iid_
iii_iif_iia_iie
氨基糖苷
类
AGATAGTTATGCCCGCAACAAG ACGCGCTGCGCCTATA
aac(3)-xa 氨基糖苷
类
CGATGGTCGCGGTTGGTC TCGGCGTAGTGCAATGCG
aac(6')I1 氨基糖苷
类
GTGTCCGTCGCCAAGGA GGTGACGGCCTTGTCGA
aac(6')-Ib 氨基糖苷
类
GCAAGCGGTTCGTGACGTA TCAGGTGCTCCTCGATCCAG
aac(6)-ig 氨基糖苷
类
GGGAATTATCGGAATAGCTCTTGG TTGGGCTGTTCTTCCTAGCTAA
aac(6')-II 氨基糖苷
类
CGTCGCCGAGCAACTTG CGGTACCTTGCCTCTCAAACC
aac(6)-iic 氨基糖苷
类
CCAAGAGCAATAAGGGCATACCAA GCCACACTATCATAACCACTACCG
aac(6)-ij 氨基糖苷
类
GCGATGTTAGAAGCCTCAATTCG CACACTTCGGCCTGTCGAA
aac(6)-im 氨基糖苷
类
CGACCCGACTCCGAACAA GCACGAATCCTGCCTTCTCA
aac(6)-ir 氨基糖苷
类
CAGTCTTTGGCTAATCCATCACAG AACGAACCCGGCCTTCTC
aac(6)-is_i
u_ix
氨基糖苷
类
ATGCCTGTATCTGAATCCCTGATG GGCAATCGCTTGTTGAGTATCTG
aac(6)-iv_i
h
氨基糖苷
类
CGTGAGCATTATACAGAGCAATGG CCATTTCCGTTCGTAGATATTGGC
aac(6)-iw 氨基糖苷
类
GCTATAACGATCAGCAGCAAGC CGCGATGCATGGCATGAC
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7
aac(6')-Iy 氨基糖苷
类
AAGCTTACTCTGGCCTGATCATG TGCCTGAACGTCGATATTCAGG
aac(6)-iz 氨基糖苷
类
TTGGCTTATACCGACACCCA CCCGTTGCGATACCTGAAC
aac3ia 氨基糖苷
类
TGCGTCAGTTACTTACACGAAC CCTGATGCATTGCATGACTGA
aac3-Via 氨基糖苷
类
GCCTCAATCCGCCACGATTA ACGCGCTCTGTTTCCTCAAA
Aac6-Aph2 氨基糖苷
类
TGCGCCATGACTACGTGAAC GACTGTCCGAAGCCAGTTCG
aacA/aphD 氨基糖苷
类
CTTGGCCTACATTAGATTCAGCTC GCTCTCAATCTTTGATAGGAGCAG
aacA43 氨基糖苷
类
AGAGCCTTGGGAAGATGAAGTTT TTGATCCATACCATAGACTATCTCATCA
aacC2 氨基糖苷
类
ACGGCATTCTCGATTGCTTT CCGAGCTTCACGTAAGCATTT
aadA_99 氨基糖苷
类
CCAACACGACGCTGCATC GCTGTCGCCACAATGTCG
aadA10 氨基糖苷
类
GTTGTGCACGACGACATCATT GGCTCGAAGATACCTGCAAGAA
aadA16 氨基糖苷
类
ACAGGCACTCAACGTCATCG CGCGGAGAACTCTGCTTTGA
aadA17 氨基糖苷
类
ACGGTGGCCTGAAGCC GAATTGCAGTTCCCGTCTGG
aadA2-1 氨基糖苷
类
TGTACGGCTCCGCAGTG CACGGAATGATGTCGTCGTG
aadA2-2 氨基糖苷
类
ACGGCTCCGCAGTGGAT GGCCACAGTAACCAACAAATCA
aadA5 氨基糖苷
类
CAATGACATTCTTGCGGGTATC GACCTACCAAGGCAACGCTATG
aadA6 氨基糖苷
类
ATCACGATCTTGCGATTTTGCT CTGCGGATGGGCCTAGAAG
aadA7 氨基糖苷
类
CCATCGAGCGTCATCTGGAA CCCGTCTGGCCGGATAAC
aadA9 氨基糖苷
类
CACTCCGCGCCTTGGA TGTGGCGGGCTCGAAG
aadB 氨基糖苷
类
CGCGGCAAGCCTATCTTG CAAATCAGCGACCGCAGACT
aadD 氨基糖苷
类
CCTGCTTGGTGGGCAGAC CGGCACGCAAGACCTCAA
aadE 氨基糖苷
类
CCGACAACATTTCTACCATCCTT ACCGAAGCGCTCGTCGTATA
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8
acc3-iva 氨基糖苷
类
TACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTA GGAACTATGTCCCTTTTAATTCTACAAT
CT
acrA 多重耐药
类
GGTCTATCACCCTACGCGCTATC GCGCGCACGAACATACC
acrB 多重耐药
类
AGTCGGTGTTCGCCGTTAAC CAAGGAAACGAACGCAATACC
acrF 多重耐药
类
GCGGCCAGGCACAAAA TACGCTCTTCCCACGGTTTC
acrR 多重耐药
类
GCGCTGGAGACACGACAAC GCCTTGCTGCGAGAACAAA
adeA 多重耐药
类
CAGTTCGAGCGCCTATTTCTG CGCCCTGACCGACCAAT
adeI 多重耐药
类
CAGTCTGGTTTGCAGTAACCA CACTCCTACAACAACAGGCAA
ampC β-内酰胺
类
CTGGCGCATACCTGGATTAC GCCAGTTCAGCATCTCCCA
ampC/blaDHA β-内酰胺
类
TGGCCGCAGCAGAAAGA CCGTTTTATGCACCCAGGAA
ant4-ib 氨基糖苷
类
GATGGCCGCTGACACATG TCAACATTGCGCCATAGTGG
ant6-ia 氨基糖苷
类
TCGCCATGAGCTGCTGA CCTATCATACTCCGGATAGGCATA
ant6-ib 氨基糖苷
类
AGAACATCCGACAGCACGTTC CCAACCTTCCATGAAATCATTCGC
aph(2')-Id 氨基糖苷
类
TGAGCAGTATCATAAGTTGAGTGAAAAG GACAGAACAATCAATCTCTATGGAATG
aph(3'')-ia 氨基糖苷
类
TAACAGCGATCGCGTATTTCG TCCGACTCGTCCAACATCAATA
aph_viii 氨基糖苷
类
AACAGGTTTGGGAGGCGATG CGCAACAAGCCTCTCCTGAA
aph3-ib 氨基糖苷
类
TCTCATGGCGATATCACGGATAG TTTCCTCCGATGCATCCTCTC
aph3-III 氨基糖苷
类
CTCTCTCATGGAGATATGAGCGCTA AATCCGGTTCAAGTCCCAACATG
aph3via 氨基糖苷
类
TCGGTATCCCGGTTGTGAG ACACGAGGTACGGGAATCC
aph3-viia 氨基糖苷
类
CGCTCCCGATTCCGGAA CACAGTTTGCCAGTGATACACA
aph4-ia 氨基糖苷
类
CGCTGGGAGCTGAAGAGG AGCATCGTGCTGCTCTCC
aph4ib 氨基糖苷
类
CAGAAGGCAATGTCATACCACTTG GACAGCCGCTTAGCCGAA
T/ZNZ 287—2024
9
aph6ia 氨基糖苷
类
GGGAACACCGTGCTCACC GTTGGTCCCGTGCAGGTC
aph6ic 氨基糖苷
类
CACGACAACGTGCTCGAC CCGTCTTCGGCGAACCA
aphA1 氨基糖苷
类
TGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCA CCTATTAATTTCCCCTCGTCAAAAA
aphA3 氨基糖苷
类
AAAAGCCCGAAGAGGAACTTG CATCTTTCACAAAGATGTTGCTGTCT
apmA 氨基糖苷
类
GGCGCACATGCATTCATCA CTATACTCCAGTCCCACCATTTGA
ArmA 氨基糖苷
类
TCTTCGACGAATGAAAGAGTCG GCTAATGGATTGAAGCCACAACC
Arr2 利福平类TTGGCGATTGGTGACTTGCTAA ATCGTCTTCGAACGGTCCTG
ARR-3 利福平类GATCGTCTTCGAACGGTCCTG TTTGGCGATTGGTGACTTGCT
arsA 多重耐药
类-可移动
CAGGTCAGCCGCATCAACC GCCTGAAACACGGCAATTTCTTC
bacA 其他ATCCGCGGCACCCTGA CCTGCTTGATGGACTTGATGAAGA
Bacteroidet
es
物种分类GGARCATGTGGTTTAATTCGATGAT AGCTGACGACAACCATGCAG
beta_ccra β-内酰胺
类
CACTGGCACGGCGATTGTA CGGCAGCCAAACCACGATA
bexA/norM 多重耐药
类
TCGGGCATCCCGTTTATGATC GTAGGCTGCGCATAATACCCA
bl1acc β-内酰胺
类
TGTTATCCGTGATTACCTGTCTGG CTCAGCGAGCCAACTTCAAATA
bl3_cpha β-内酰胺
类
GCAAGTTGAAGCGAAAGAAAAGA TACCAGTATCAATCGCATATACACCTAA
bla1 β-内酰胺
类
CACACAGCTGATGGCTTATCTAAAA AATAAACGCGATGGGTTCCA
blaACC-1 β-内酰胺
类
AAGCCGCTCAAGCTGGA GCCATATCCTGCACGTTGG
bla-ACT β-内酰胺
类
CGTGCCGGAGGTCTTGAATA GGGATAGTAAACCTGAAACTCGGA
blaB-11,13,
14
β-内酰胺
类
TGATTTGAGGGATACGACAACTCC CTGTAATACTCCGAGCACCAA
blaCARB β-内酰胺
类
AAAGCCTCATGGGTGCATAAA ATAGCTTTTGTTTGCCAGCATCA
blaCMY β-内酰胺
类
CGTACCGAGCCGACGTTAA CAACCCAGGAAGCAGGCA
blaCTX-M β-内酰胺
类
CCTACGGCTATTCGAAGGAAGATAAG CCGGATTGGCCTGGAAGC
blaCTX-M-1, β-内酰胺GCAATGTGCTCAACGTTCAAG GTGCCTGAGTCAATTCTTTCAAAG
T/ZNZ 287—2024
10
3,15 类
blaFOXnew β-内酰胺
类
CTTGGGCTTGAATGCTCAGGTA TGTATGGTCGTAGTGAGCCTGA
blaGES β-内酰胺
类
GGGCAACCGCATTCTGAC GCATCTCCCACTTTATCGTCAC
blaGOB β-内酰胺
类
ACATCTACACCTGCAGCAGTAG AATCGCTTGGTACGCTAGCA
blaHERA β-内酰胺
类
AGCCGGACTAGAGCTTCATG GGCAGAACTCATCATCTGCAAA
blaIMI β-内酰胺
类
CGCCTGTTAAACCCAACCTGTA CGCTCTGTCATCATGAGAGTGG
blaIMIR β-内酰胺
类
CACCGGGTTACCAGCTGAAG GCGAAGCTGCGCTTGTAGTC
blaIND β-内酰胺
类
TGTTCGCCTGTGTGTTATCTCC GCAGCACTTTAAAGGTGCTCAC
bla-L1 β-内酰胺
类
CGGTCTGCCGTTACAGGTG AAAGACCCGCGTCGTCATG
blaLEN β-内酰胺
类
CTATGTCAATGTGCCGAAGCA GGCTTGTCCTCTTTCGAATAGC
blaMIR β-内酰胺
类
GGCGACTTGCGCCGTAT TTTTCTGCTCGGCCATGAG
blaMOX/blaC
MY
β-内酰胺
类
CGACCGAGTATGTACCTGCTTC TCAAGTCCAATACGACGAGCTA
blaOCH β-内酰胺
类
AAAGGTGACCGCATTCGC CCAGCGTCAGCTTGCG
blaOXA10 β-内酰胺
类
CGTTCAGGCGGCAGGTT GCCGCGATATAAGATTTGAGAATT
blaOXY-1 β-内酰胺
类
CGCCGTACAACCGGTGAT GAAGTAATGCGGTTCTCCTTTCA
blaOXY-2 β-内酰胺
类
GCAAATGAAGCGCAGATGC GACCACAGTACCAGCTGGTA
blaPAO/PDC β-内酰胺
类
GCAAAGGCATGACGATTGC CGCGCTGTTGTCGCTAAA
blaPER β-内酰胺
类
CCGCCGCCATCCAGTA GGGCCGCCAAGATGCT
blaPSE β-内酰胺
类
TTGACCGCTGGGAAACGG TCCGGTCTTATCGGCGATAAAC
blaROB β-内酰胺
类
GAGGAAGACTTTGATGGGAGGATTG CGCTATATTGCAATGCAGCAGAAG
blaSFO β-内酰胺
类
CGCCGCATACACTATTCTCAG GCTTCATTCAGCTCCGGTTC
blaSHV-11 β-内酰胺ACACTTTGCCATTGCTGTTTATGT TGCAAATTTCGGCAATAATCTTT
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11
类
bla-SME β-内酰胺
类
CCCGATGCAAAGCGTTATG GAAAGATTCCCTTTATCTATCTCAGACA
A
blaTEM β-内酰胺
类
GCACTTCTCGCGGAGATTG CGACGGTGATGCGTACGTT
blaTLA β-内酰胺
类
GGAGATAAAGTAACAAATCCAGTTAGATATG
A
TGCTTAATTTTCCATTTGCGATAAG
blaVEB β-内酰胺
类
CGCTCTGTGTCAGGATGAAGAG CTTTCTTATGTGCTAGGGCGATCA
blaVIM β-内酰胺
类
GGAGTGAGGCTGACCGTAGAAG ATCGGCGAAACGCACAAA
blaZ β-内酰胺
类
ATCGGCCAGACTGGATATCGA CACAGCTCCAGTTGCAACAAC
cadC 多重耐药
类-可移动
AATGACCGTATGCTGCAAGAAG TTTGCCTGCTATGGCATTCTG
carB 链阳霉素B
类
GCTACTATTCCGGCTATTACCATG GGGCTCCTCGTTCATGTAGA
cat 利胆醇类GCACTCGATGCCTTCCAAAA AGAGCCGATCCAAACGTCAT
cat(pC221) 利胆醇类CACTCGACGCCTTCCAAAG CCGAGCCTATCCAGACATCATT
catA1 利胆醇类CACCTTATGAAGTGGTCGGTTCA GTCTGATGAACACAGAGACTGCA
catA2 利胆醇类GGGTGAGTTTCACCAGTTTTGATT CACCTTGTCGCCTTGCGTATA
catA3 利胆醇类CCTGGAACCGCAGAGAACA CGGAACTCCGGAAACTGATTAAC
catB2 利胆醇类CTGATTGCTCAGGCCGTGAA ATGAGTATGGGCAACTCAGTGC
catB3 利胆醇类CCTTTGGACTGAGTGTAAGTCTGA TAAAGCCATCGAAGGTTGACCA
catB8 利胆醇类AGGTGCACTTACAGTATGACTGC AACGTGGGAAGTTCTCGTCATAC
catB9 利胆醇类CAGGATCTGATGTGGGAGAACTA TCGGGAACCATTTGTTGGC
catP 利胆醇类TAGTTGGCGAAGTAATCGCAAC TGCGATGCCATAACCGATTATG
catQ 利胆醇类ATCAACACGGACCAGGACAAG GGAAAGTCCGCTCACGATGA
cefa_ampc β-内酰胺
类
AGTTGCGCAGAACAGTCCTCTT TCGTATCTTGCCCGTCGATAAT
cefa_qacelt
a
多重耐药
类-可移动
GCAGCGTTGCTGGACACA GTTCGGGATAAACGTGGTGACT
ceoA 利胆醇类GCAAAATTCAGAGCAAGTTACGAA AAAATGACTCCCAACCTGCTTTAT
cepA β-内酰胺
类
TCATTCCTCGTTCAAGTTTTCAGA TGCAGCACCAAGAGGAGATGT
cfiA β-内酰胺
类
TAGGAAGCATCGGAACGTTGAT CAGACCGAGCACGACTGTTG
cfr 链阳霉素B
类
GCGCTCTTCGAGGATTCG CCGCCCAAGCAGAAGTAGAC
cfxA β-内酰胺
类
GCCCTCATCACCGTCTTCG GGACGTTGGCGATGGAGAG
cmlA1 多重耐药CGGCATCGTCAGTGGAATT CGGTTCCGAAAAAGATGGAA
T/ZNZ 287—2024
12
类
cmlA5 利胆醇类GCGATCGCCATCCTCTGT TCGACACGGAGCCTTGGT
cmlV 利胆醇类TGCACCTGACVGGSCAYAT GVACTTCRCGGAACATRCC
cmr 多重耐药
类
GCGAGCTGCACAAGCTGAT CGGCCCAGTCGCTCTTC
cmx(A) 多重耐药
类
GTAACGCCTACTGGAAGTCCA CAGCTTCTCCTTGAGAATGCAG
copA 多重耐药
类-可移动
AGATGTTATCGACCACTTCGGA CCGCTTGGCGATAAGCG
cphA β-内酰胺
类
GCGATAACGTGGCGATGAAT GTCGAGACGGAACGTTTCGT
cro 可移动遗
传元件
GCCTTGTTCATCGGCGAAC GGCAATGTCGCCTTCGTTC
czcA 多重耐药
类-可移动
GGAATGGCCCTGATATTCCA AGTCTTGCGTCCAACCAACAG
dfrA1 甲氧氨苄
嘧啶
CTTCAACTATCACAGAGCACGAAG TCTACCGGTACATACACATCAGC
dfrA10 甲氧氨苄
嘧啶
CCTCTACCGAACCGTCACACA GCGACAGCGTTGAAACAACTAC
dfrA12 甲氧氨苄
嘧啶
CGGATCATGTCATTGTTTCAGG ATGTTAGAGGCGAAGTCTTGG
dfra14 甲氧氨苄
嘧啶
AGGCCGAAAGACTTTCGAGTC TCACCTTCTGGCTCAATGTCG
dfrA15 甲氧氨苄
嘧啶
CGGGAACGGCCCTGATATTCC CGTGTTGCGACCGCATACTTTC
dfra17 甲氧氨苄
嘧啶
GGAGCGAATCAAGGAGAAAGGAA GCAATGCGTTGATCGGTATTCTC
dfrA18 甲氧氨苄
嘧啶
TTGTTTCAACGCTGTCGCA GGTTTCGGTTGAGACAAGCTC
dfra21 甲氧氨苄
嘧啶
CAGCCGAACACGGCAAAG CGGAGTGCGTGTACGTGA
dfrA22 甲氧氨苄
嘧啶
TCAAACTGGACAGCGGCTA GTCGATTGTCGACACATGCA
dfrA25 甲氧氨苄
嘧啶
GCCGCTCAGGATCGGTA GTCGAGATATGTAGCGTGTCG
dfrA27 甲氧氨苄
嘧啶
CCATGGAGTGCCAAAGGTG CACCTTTGGCACTCCATGG
dfra5 甲氧氨苄
嘧啶
GTAATCGGTAGTGGTCCTGA ATCAGGACCACTACCGATTAC
dfra7 甲氧氨苄
嘧啶
GGTCGCACCTGCATCGTTA AGCGCCACCAATGACGTAG
dfrA8 甲氧氨苄CGGTTCGCATTCCCATCAAA CGCAGTCATGGGATAAATCTGG
T/ZNZ 287—2024
13
嘧啶
dfrAB4 甲氧氨苄
嘧啶
ACCAAGGCAGAAGTGAAGTCA GGTGAGCCTCAGACTCGAC
dfrBmulti 甲氧氨苄
嘧啶
GTCGCTCACGATAAACAAAGAGTC CCCTTCATGGTGAAATGAAGCTTG
dfrC 甲氧氨苄
嘧啶
TCAATCGGAAGAGCCTTACCTGA TGGGCAAATACCTCATTCCATTCC
dfrG 甲氧氨苄
嘧啶
TGCTGCGATGGATAAGAACAG CTTCCAGGTAATGCTCTTCCG
dfrK 甲氧氨苄
嘧啶
CCCATCACCGCTGAACTGG TGGGCGCTGCCATCTAAAC
EAE_05855 可移动遗
传元件
AGCGTTCGTCCTGCACAAGT TCCACCATGCTCAGGGAGAT
ecfX-P.
aeruginosa
物种分类CTTTTCTCTAACCGTACATTATCTACGATAA
A
AGAACGTAGCGACTGATAAAATGCT
emrB/qacA 多重耐药
类
CTCAGCAGTATGGTGGTAAGCATT ACCAGGCGCCGAAGAAC
emrD 多重耐药
类
GATAATTCTGCTGGCGCACA GCAGGCGTGGTCACAAC
ere(A) 链阳霉素B
类
TCGTATATGGCGGGCGTAGTA GGTCCAAGATGGGTGAATGCA
ere(B) 链阳霉素B
类
AAAGCGGTTTACAAGCGTTTCG GGGTGCTCTAGGGTTGTTTAGTG
erm(34) 链阳霉素B
类
CCTTCAGTCAGAACCGGCAA GCTGATTTGACAGTTGGTGGTG
erm(35) 链阳霉素B
类
GGCGGACCGACTTGCAT TCTGCGTTGACGACGGTTAC
erm(36) 链阳霉素B
类
TGTTGAGATTGGGCCTGGA CTAAGGGTGGGTTCTCACTATCTA
erm(42) 链阳霉素B
类
GTTTGATATTGGCATTGTCAGAGAAA ACCATTGCCGAGTCCACTTT
erm(A) 链阳霉素B
类
TCGTTGAGAAGGGATTTGCGA TTGCATGCTTCAAAGCCTGTC
erm(B) 链阳霉素B
类
ACATTTTACCAAGGAACTTGTGGAA GTGGCATGACATAAACCTTCATCA
erm(D) 链阳霉素B
类
GAACACTAGGGTTGTTCTTGCA CTGGAACATCTGTGGTATGGC
erm(E) 链阳霉素B
类
TTTCCGGACAGCATTTGATGC TCCACTGCCAATACCTTACCG
erm(F) 链阳霉素B
类
GTCACGCAGCTGGAGTTCG CGGTGAAGCACAGCTCGAC
erm(G) 链阳霉素B CAGCTTTGGTTGAACATTTACGAA AAATTCCTAAAATCACAACCGACAA
T/ZNZ 287—2024
14
类
erm(O) 链阳霉素B
类
CCCTTGAATTAGTACAGAGGTG GCAAACTCGTATTCCACGA
erm(Q) 链阳霉素B
类
TGATGACGGCTCAGTGG GTGCACCAGCGCCTGA
erm(S) 链阳霉素B
类
TGAAAGCCATGCGTCTGAC TTCAGCTGGCAGCTTAAGC
ermA/ermTR 链阳霉素B
类
GAGTACGCCCGCAAACG GCGTTCGATCCGGAGGA
ermK 链阳霉素B
类
GTTCACTAGCACTATTTTTAATGACAGAAGT GAAGGGTGTCTTTTTAATACAATTAACG
A
ermT 链阳霉素B
类
GCTCAGTGGTCCCCATGGT ATCCCCCCGTCAACGTTT
ermX 链阳霉素B
类
TTGTCTTTGAAAGTGAAGCAACAGT TAACGCTAGAGAACGATTTGTATTGAG
ermY 链阳霉素B
类
CAGGAGCAGGAAATCCAAGC CCAGCTTCCATTCCTTCTGC
fabK 其他TGGTGTGGCTGTTGCAATCTTA CCAAGGTACAAAGCACCTTGGA
fexA 多重耐药
类
GGAGYATGTGGTTTAATTCGAAGCA AGCTGACGACAACCATGCAC
Firmicutes 物种分类AACCCGCCCTCTGGATCA GCCGTCGAGAAGAAGACGAA
floR 多重耐药
类
CGAGCAGTTCCTGCCAAAG CCCAGTCATCCGGTTCATAATC
folA 磺胺类CTTGCAGGCCTATGGATTGC TCTGTTCTCAAGTGTGCCAGTA
fosb 其他AGCTGGTTTGTGGATTTGCA CCACACCGAGAGCTTTAATCCG
fosX 其他ACGGCCGAATATGACGAATTC AGAGTGATCTGCTCATGAA
gltA-K.
pneumoniae
物种分类GGAATAGAGTGGCTTAATTC GGTTTAACAAAACAACCACC
imp-marko β-内酰胺
类
ATAATGATTCACCGGGGTAG CTTCAGGCTATCGTTTCG
IncHI2-smr0
018
可移动遗
传元件
CGAAAGCCGGACGGCAGAA TCGTCGTTCCGCCAAGTTCGT
IncI1_repI1 可移动遗
传元件
GGAACGTTTGTAYCTTGTATTG ACTCACTATCTTCTGTTGATTG
IncN_korA 可移动遗
传元件
TTGGGCTTCATAGTACCC GTGTGATAGCGTGATTTATGC
IncN_oriT 不相容性
质粒
AGTTCACCACCTACTCGCTCCG CAAGTTCTTCTGTTGGGATTCCG
IncN_rep 不相容性
质粒
CAGCCTCGCAGAGCAGGAT CAGCCGGGCAGGATAGGTGAAGT
IncP_oriT 不相容性
质粒
TTCGCGCTCGTTGTTCTTCGAGC GCCGTTAGGCCAGTTTCTCG
T/ZNZ 287—2024
15
IncQ_oriT 不相容性
质粒
AGCGTATGAAGCCCGTGAAGGG AAAGATAAGCGGCAGGACAATAACG
IncW_trwAB 不相容性
质粒
GCCTTGATGTTACCCGAGAG GATCGGTCGAATGCGTGT
int1 整合酶TGCTTTTCCCACCCTTACC GACGGCTACCCTCTGTTATCTC
intl2 整合酶GCCACCACTTGTTTGAGGA GGATGTCTGTGCCTGCTTG
intl3 整合酶GTCTTAAGGTGGGCTGCGTG CCCCGAATCTCATTGATCAGC
IS1111 插入序列GCAGCGTCGGGTTGGA ACGCGTTCGAACAACTGTAATG
IS1133 插入序列CGGCCGTCACTGACCAA TCGGCAGGTTGGTGACG
IS1247 可移动遗
传元件
CAATACCTTTGATGGTGGCGTAAG CTTACGCCACCATCAAAGGTATTG
IS15DI 可移动遗
传元件
CCAAATACCGAAGACAAGCGTTC CCAAACTGCTCGTAAAGCATCAG
IS200-1 可移动遗
传元件
GCACACCCGATGGAACTGTAAA TCGGCGGGATCTCCAGAAG
IS200-2 可移动遗
传元件
GGTCCGTCAGGCACAAGTC GGGATCGTATCGGCAAGCC
IS21-ISAs29 可移动遗
传元件
CTTGCGCATCATTGGATGATGG AAGAACGGCTCCAATTAAGCGA
IS256 可移动遗
传元件
ATGGATGAAACCTACGTGAAGGTC CGGTACTTAATCTGTCGGTGTTCA
IS26 可移动遗
传元件
CGGTCTGAGCTTCGGGAA AGAACTGTCACTCCGGTCTG
IS3 可移动遗
传元件
TTCTCGAAGAATCGCCATGGC GCTTTGGATCGCTCCAATCGA
IS5/IS1182 可移动遗
传元件
ATATCGTGCCATTGATGCAGAG ACCATTGCTACCTTCGTTGAAG
IS6/257 可移动遗
传元件
CGCACCGGCTTGATCAGTA CTGCCACGCTCAATACCGA
IS6100 可移动遗
传元件
AGGTTCGGACTCAATGCAACA TTCAGCACATACCGCCTTGAT
IS613 转座酶CCGCCACCAGTGTGATGG TTGGCGCTGACTGGATGC
IS630 可移动遗
传元件
GGATGCCACTGCTGGTCA ACAGTGGATACAGTATCTGCTGAG
IS91 可移动遗
传元件
TCAGAGGCAGCGGTATACGA GGTTGATTCAGTTAAAGTACGTAAAACT
TT
ISAba3-Acin
eto
插入序列ATGGTTTCATGCGGGTT CTGAGGGTGTGAGCGAG
ISCR1 可移动遗
传元件
CATGCTCTGCGGTCACTTC GACGCACCTTCTTGATGACC
ISEcp1 可移动遗
传元件
AGGTGTCCATGACGTGAAAGTG TCCTTTGTCCCCTAGGATATTGG
T/ZNZ 287—2024
16
ISEfm1-Ente
ro
插入序列CACACTGCAAAAACGCATCCT TGTCTTTGGCGTCACAGTTCTC
ISPps1-pseu
d
插入序列TGGATCGACCGGTTCCAT GCTGACCGAGCTGTCCATGT
ISSm2-Xanth
ob
插入序列GCCGCCAATTTGTTGCTGAA GCCGGTCGTGTTTCCCTTT
KPC β-内酰胺
类
TTCAGATGCAATGGCGTTTG ATAATCGGGAACATAATGAGCATAACTA
C
lmrA 链阳霉素B
类
GTGAACTGGCAGATGAGGAAGG TTCTCCTCGTCGCCAAACTAGAT
lncF_FIC 可移动遗
传元件
ATACCGGTCATTTCCACTTGGC GCATCAGGCTGATGAGGTTCAA
lnu(F) 链阳霉素B
类
TGACGCTCAACACACTCAAAAA TTCATGCTTAAGTTCCATACGTGAA
lnuA 链阳霉素B
类
GGATCGTTTACCAAAGGAGAAGG AGCATAGCCTTCGTATCAGGAA
lnuB 链阳霉素B
类
GGGTGTAGATGCTCTTCTTGGA CTTTACCCGAAAGAGTTTCTACCG
lnuC 链阳霉素B
类
AAACGGCGTGAAAGTATCAGG TTGTGGTGATGTAACGGATGC
lsa(C) 氨基糖苷
类
GCTGTTGATGACATTGCTCACA CGGCGTACTGGTGAAGCTAAC
marR 多重耐药
类
CACATCGACGGCGTATTCTG CAACGAGCATACCGACATCG
mcr-1 其他CGGCGTACTTTAAGCGTTATGATG GCATTTGGCATACCATGCAGATAG
mcr-2 其他ACAAGCCCAGGGCCAAC CCTTAATGGTGCCTTCGGTTTC
mdtA 多重耐药
类
CGTCGGCGCACTCGTT TCCAGACGTTGTACGGTAACCA
mdtE/yhiU 多重耐药
类
TTCCAGCCGGTCAGCAA GACATCTCCCGCGAGTTCG
mdtg 多重耐药
类
ATGCTGGCTGTACAAGTGATG CACTCCAGCGGGCGATA
mdth 多重耐药
类-染色体
GGTTACGGACAAGGTGAAATACTGAT TGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAAT
A
mecA β-内酰胺
类
CGCAACGTTCAATTTAATTTTGTTAA TGGTCTTTCTGCATTCCTGGA
mecA-Staphy
lococci
物种分类CCGATAGGCTTACTTGTTGCAG AGTCCACTTGCGGTTTCATTG
mef(B) 链阳霉素B
类
TAATTATCGCAGCAGCTGGTTC GTTCCCAAACGGAGTATAAGAGTG
mefA 链阳霉素B
类
ATCGGTCGCTCTTCGTTCAC ATAAATAGGATCGAGCTGCTGGAT
T/ZNZ 287—2024
17
mepA 多重耐药
类
GTGCCGTCCAAGATCATG GGTGGAAGTCCAGTAGGGTGA
merA-marko 多重耐药
类
AGGACAACGCTATGCAACGAA CCGGAAAGGGCCGAAAT
mexA 多重耐药
类
CTGGAGATCGACGACGAGAAG GAAATCGTTGACGTAGCTGGAA
mexB 多重耐药
类
GGTCAGCACCGACAAGGTCTAC AGCTCGACGTACTTGAGGAACAC
mexE 多重耐药
类
GCTTCCCGTAACGAGGTAGT CCTTGAACGGTATCAGCACG
mobA 可移动遗
传元件
TCAGCGGGATGATCGACTG GAGGGCGTAGAGGGCGTA
mphA 链阳霉素B
类
CGCAGCGCTTGATCTTGTAG TTACTGCATCCATACGCTGCTT
mphB 链阳霉素B
类
CTGCTAACACAAGTACGATTCCAAAT TCAAGTAAAGTTGTCTTACCTACACCAT
T
msr(A) 链阳霉素B
类
TCAGACCGGATCGGTTGTC CCTATTTTTTGGAGTCTTCTCTCTAATG
TT
msr(C) 链阳霉素B
类
GGCAAGCTAGGTGTTGAGC ATTGCTCAACACCTAGCTTGC
msr(D) 链阳霉素B
类
CGGCAGATGGTCTGAGCTTAAA CGCACTCTTCCTGCATAAAGGA
msr(E) 链阳霉素B
类
CGGAGTCCATCGACCATTTG ATCGTCGGCAAGGAGAATCA
mtrD 多重耐药
类
CGATGTGTCGTTTTGGAAGGT CCTGCACCATGATTCCTCAATA
mtrE 多重耐药
类
AATTTTGCCGATTATTGCTGAAA GATTGTCATCATTCGTTTATCACCAA
multidrug
resistance
多重耐药
类
GGCCACACCAGTGACAATATCA CAGGCAGCCACCAAAAGC
NDM new β-内酰胺
类
TGCGCCAAGATAGGGCATA GTCGTGAATTCGGCAGGTTTA
nimE 多重耐药
类
GGGAGAGTTGCCGATGTTGTA AGCCACTCGTTAAAGGGCAAT
nisB 其他ATGTCCATGGCACAGACTGTG CCTGTCTTGTCACCCGTTACC
nonmobile
blaBEL
β-内酰胺
类
GGTATGGCTGTGGGTGTTATTCA AGGCAAGGTTACCACTTGTATACG
nonmobile_b
laADC
β-内酰胺
类
ATCGCCGTTTGGTGGTACG TCCACCAATCCCTGGTCCTAAA
norA 多重耐药
类
CCCGGAGTCGATGTTCGA GCCGAAGACGTACACGAACAG
oleC 链阳霉素B TCTTGGTGGTCACTTGAAGC ACTCTTGTGGTTGTGGAGCA
T/ZNZ 287—2024
18
类
ompA-A.
baumannii?
物种分类ATGAAGTGGAGCGCCATTG GGCCACGGCGAACTGA
oprD 多重耐药
类
GGTGGATGAAGTCCGTACGG AGGTTAGACCTCCAAGAGCCA
optrA 利胆醇类GAGTCAACCTACCTCCACTATCA GCTGCGAGTTATCCAGCAG
oqxA 氟喹诺酮
类
GCCGGGTTGTGCAAATAGAC TGGCAATCTGTCGCTGCTG
orf37-IS26 插入序列GCGCGTCGAGCATCAATAG CAGTTGTGCTGCTGGTGGTC
orf39-IS26 插入序列GGTAAGATTACCGATAAACT GTTCGTGAAGAAGATGTA
pAKD1-IncP-
1β
质粒-复制CAGGCTCTTAATGTGATA TTATGCTCAATACTCGTG
PAMBL-1-F_3
77old
质粒-复制CCGGTGCCATTGGTTTAGA AAAATAGCCGCCCCAAGATT
pbp β-内酰胺
类
GGCGAACTTCTAATTAATCCTATCCA CGCCGATGACATTCTTCTTATCTT
Pbp5 β-内酰胺
类
GATGCGCACTGGGCTTG TCGGAATATGCGGAAATGCG
pbrT 多重耐药
类-可移动
CAATCCATCGACAATCAC GACAATCAGCTACTTCAC
pBS228-IncP
-1α
质粒-复制TGGCGTATGGAGTTTCAATGC GAATAATGCCGTGCCAGTGAA
pcoA 多重耐药
类-可移动
AGACGGTAACGTATAACTTTTTGAAAGA GCGTGTAGCCGGCAATG
penA β-内酰胺
类
GCAATCGAGGCGGTGTTC TTGCCGCAGCCAATTCA
pica 链阳霉素B
类
TCGTGGGCCAGGTGAAGA TTCCCCTTGCCGGTGAA
pikR2 链阳霉素B
类
TTTGCAGGTTTTGTTCCTAATGC GCAGAGCCTGATTTCTCCTTTG
pmrA 其他TTGTGACCTATTCCCCTGTAATAGAA TGCGAAGCACGCATCATC
qacA/B 多重耐药
类-可移动
AAGGGCCACTGCATTAGCTG CCAGTCCAATCATGCCTGCA
qacF/H 多重耐药
类
TCGCAACATCCGCATTAAAA ATGGATTTCAGAACCAGAGAAAGAAA
qacH_351 多重耐药
类
GTCGGTGTTGCTTATGCAGTCT CAACCAGGCAATGGCTGTAA
qepA_1_2 多重耐药
类
GGGCATCGCGCTGTTC GCGCATCGGTGAAGCC
qnrA 氟喹诺酮
类
AGGATTTCTCACGCCAGGATT CCGCTTTCAATGAAACTGCAA
QnrB4 氟喹诺酮TCACCACCCGCACCTG GGATATCTAAATCGCCCAGTTCC
T/ZNZ 287—2024
19
类
qnrB46,47,4
8
氟喹诺酮
类
CGACGTTCAGTGGTTCAGATCTC GCCAAGCCGCTCCATGAG
qnrB-bob_re
sign
氟喹诺酮
类
GCGACGTTCAGTGGTTCAGA GCTGCTCGCCAGTCGAA
qnrD 氟喹诺酮
类
CGCTGGAATGGCACTGTGA GCTCTCCATCCAACTTCACTCC
QnrS1_S3_S5 氟喹诺酮
类
CCACTTTGATGTCGCAGATCTTC CCCTCTCCATATTGGCATAGGAAA
qnrS2 氟喹诺酮
类
TCCCGAGCAAACTTTGCCAA GGTGAGTCCCTATCCAGCGA
QnrVC1_VC3_
VC6
氟喹诺酮
类
CTCACATCAGGACTTGCAAGAA ATGAAGCATCTCGAAGATCAGC
QnrVC4_VC5_
VC7
氟喹诺酮
类
TTCCTTTAAACGGGCAAACCTC CGATACCTGATTCATGAAGCTAGC
sat4 氨基糖苷
类
GAATGGGCAAAGCATAAAAACTTG CCGATTTTGAAACCACAATTATGATA
silE 多重耐药
类-可移动
GGTGGAAAGTCATCAGAGGATGA CAAAGCCCAGCAAGGATGC
spcN 氨基糖苷
类
GCTATGTGCTGGTGGACTGG GGAACCACTCGACGAACTCG
spec_aph 氨基糖苷
类
GGTGCTGATATGAATGCCTTTGG CATTGGGCGCATCAATAAATGG
str 氨基糖苷
类
AATGAGTTTTGGAGTGTCTCAACGTA AATCAAAACCCCTATTAAAGCCAAT
strA 氨基糖苷
类
CCGGTGGCATTTGAGAAAAA GTGGCTCAACCTGCGAAAAG
strB 磺胺类GCTCGGTCGTGAGAACAATCT CAATTTCGGTCGCCTGGTAGT
sugE 多重耐药
类-可移动
CTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGA GCATCGGGTTAGCGGACTC
sul1 NEW 磺胺类GCCGATGAGATCAGACGTATTG CGCATAGCGCTGGGTTTC
sul2 磺胺类TCATCTGCCAAACTCGTCGTTA GTCAAAGAACGCCGCAATGT
sulA/folP 磺胺类CGCGCTCAAGGCAGATG GGGAATGCCATCTGCCTTG
sulIII 磺胺类CAGGCTCGTAAATTGATAGCAGAAG CTTTCCTTGCGAATCGCTTT
tcrB 多重耐药
类-可移动
GTGCCGGAACTCAAGTAGCA GCACCGACTGCTGGACTTAA
terW 多重耐药
类-可移动
TCAAAGAGCTACGCGAGTCATA CCTTCCCTGTGGACTCACC
tet(32) 四环素类AGAATACTCAGCAGAGGTCAGTTCCT TGGTAGGTCGATAACCCGAAAAT
tet(36) 四环素类AAGCGACATTAGCCGGTTTAG CTGCTCGTACTTAAGCCAAGG
tet(38) 四环素类TATAGCGGGTCCGGTAATAGGTG CCATAACGATCCTGCCCATAGATAAC
tet39 四环素类CTGTCCGTGCGCAATATATCC GGATATATTGCGCACGGACAG
T/ZNZ 287—2024
20
tet40 四环素类CTCATGTAGATGCAGGAAAGACG GTAACTGCTGCCTGAATTGTGA
tet44 四环素类CCATTACTTCGGACAACGGTAGA CAATCTCTGTGAGGGCATTTAACA
tetA 四环素类CTCACCAGCCTGACCTCGAT CACGTTGTTATAGAAGCCGCATAG
tetB 四环素类GGAAACCTTAGTTCAGTGACTTGG CCCATTTAACCACGCACTGAA
tetbP 四环素类AGTGCGCTTTGGATGCTGTA AGCCCCAGTAGCTCCTGTGA
tetC 四环素类TGGGCGACAGTAGGCTTAGAA TGACCCTACTGAAACATTAGAAATATAC
CT
tetD 四环素类ACTGGTAAGGTAAACGCCATTGTC ATGCATAAACCAGCCATTGAGTAAG
tetE 四环素类AATTGCACTGCCTGCATTGC{EndPos:952
}
GACAGATTGCCAGCAGCAGA{EndPos:
1127}
tetG_F 四环素类TTGGCGCTGTATGCAATGAT CGACGACCTATGCGATCTGA
tetH 四环素类TCGCGTTCCTGCTTGCC CCGCGAGCGACAAACCA
tetJ 四环素类TTTGGGTCATCTTACCAGCATTAA TTGCGCATTATCATCGACAGA
tetK 四环素类CAGCGCCCATACGCCATTTA CCTACTTCAGTAGTGTGCCAAGC
tetL 四环素类CAGCAGTCATTGGAAAATTATCTGATTATA CCTTGTACTAACCTACCAAAAATCAAAA
TA
tetM 四环素类ATGGTTGTAGTTGCGCGCTATAT ATCGCTGGACCGACTCCTT
tetO 四环素类GGAGCGATTACAGAATTAGGAAGC TCCATATGTCCTGGCGTGTC
tetPA 四环素类CAACATTAACGGAAAGTTTATTGTATACCA TTGACGCTCCAAATTCATTGTATC
tetPB 四环素类TGGCAAGACGAGTTTGACTGA GATCGCTCCACTTCAGCGATAA
tetQ 四环素类CGCCTCAGAAGTAAGTTCATACACTAAG TCGTTCATGCGGATATTATCAGAAT
tetR 四环素类CCGTCAATGCGCTGATGAC GCCAATCCATCGACAATCACC
tetS 四环素类TTAAGGACAAACTTTCTGACGACATC TGTCTCCCATTGTTCTGGTTCA
tetT 四环素类CCATATAGAGGTTCCACCAAATCC TGACCCTATTGGTAGTGGTTCTATTG
tetU 多重耐药
类
GTGGCAAAGCAACGGATTG TGCGGGCTTGCAAAACTATC
tetW 四环素类ATGAACATTCCCACCGTTATCTTT ATATCGGCGGAGAGCTTATCC
tetX 四环素类AAATTTGTTACCGACACGGAAGTT CATAGCTGAAAAAATCCAGGACAGTT
Tn3 可移动遗
传元件
GCTGAGGTGTTCAGCTACATCC GCTGAGGTAGTCACAGGCATTC
TN5 插入序列CAGCATAAAAAATCCCGACAACA CCCCGCAACAGACATACGT
TN5403 可移动遗
传元件
AAGCGAATGGCGCGAAC CGCGCAGGGTAAACTGC
tnpA-1 转座酶GCCGCACTGTCGATTTTTATC GCGGGATCTGCCACTTCTT
tnpA-2 转座酶CCGATCACGGAAAGCTCAAG GGCTCGCATGACTTCGAATC
tnpA-3 转座酶GGGCGGGTCGATTGAAA GTGGGCGGGATCTGCTT
tnpA-4 转座酶CATCATCGGACGGACAGAATT GTCGGAGATGTGGGTGTAGAAAGT
tnpA-5 转座酶GAAACCGATGCTACAATATCCAATTT CAGCACCGTTTGCAGTGTAAG
tnpA-6 转座酶TGCAGATGGTTTAACCTTGGATATTT TCGGTTCATCAAACTGCTTCAC
tnpA-7 转座酶AATTGATGCGGACGGCTTAA TCACCAAACTGTTTATGGAGTCGTT
tolC 多重耐药GGCCGAGAACCTGATGCA AGACTTACGCAATTCCGGGTTA
T/ZNZ 287—2024
21
类
Tp614 转座酶GGAAATCAACGGCATCCAGTT CATCCATGCGCTTTTGTCTCT
tra-A 质粒AAGTGTTCAGGGTGCTTCTGCGC GTCATGTACATGATGACCAAAA
traN 质粒GCTTGGCGGTCAGCAATT TTAGGAATAACAATCGCTACACCTTTA
trb-C 质粒CGGYATWCCGSCSACRCTGCG GCCACCTGYSBGCAGTCMCC
trfa 转座酶ACGAAGAAATGGTTGTCCTGTTC CGTCAGCTTGCGGTACTTCTC
ttgA 多重耐药
类
ACGCCAATGCCAAACGATT GTCACGGCGCAGCTTGA
ttgB 多重耐药
类
TCGCCCTGGATGTACACCTT ACCATTGCCGACATCAACAAC
vanA 糖肽类GGGCTGTGAGGTCGGTTG TTCAGTACAATGCGGCCGTTA
VanB 糖肽类TTGTCGGCGAAGTGGATCA AGCCTTTTTCCGGCTCGTT
vanC 糖肽类CCTGCCACAATCGATCGTT CGGCTTCATTCGGCTTGATA
vanC2/vanC3 糖肽类TGACTGTCGGTGCTTGTGA GATAGAGCAGCTGAGCTTGTTC
vanD 糖肽类CAGAGGAACATAATGTTTCGATAAAATCT GCCGGATTTTGTGATTCCAA
vanG 糖肽类TGTTTCGCAGAACCGTGTCAA CCCTGCACTGTTCCATCTTCTC
vanHB 糖肽类GAGGTTTCCGAGGCGACAA CTCTCGGCGGCAGTCGTAT
vanHD 糖肽类GTGGCCGATTATACCGTCATG CGCAGGTCATTCAGGCAAT
vanRA 糖肽类CCCTTACTCCCACCGAGTTTT TTCGTCGCCCCATATCTCAT
vanRB 糖肽类GCCCTGTCGGATGACGAA TTACATAGTCGTCTGCCTCTGCAT
vanRC 糖肽类TGCGGGAAAAACTGAACGA CCCCCCATACGGTTTTGATTA
vanRC4 糖肽类AGTGCTTTGGCTTATCTCGAAAA TCCGGCAGCATCACATCTAA
vanRD 糖肽类TTATAATGGCAAGGATGCACTAAAGT CGTCTACATCCGGAAGCATGA
vanSA 糖肽类CGCGTCATGCTTTCAAAATTC TCCGCAGAAAGCTCAATTTGTT
vanSB 糖肽类GAAGATAAAGAGGGAAGCGTACTC CCGAATTGTCAGCCCTTGATAA
vanSC 糖肽类ATCAACTGCGGGAGAAAAGTCT TCCGCTGTTCCGCTTCTT
vanTC 糖肽类ACAGTTGCCGCTGGTGAAG CGTGGCTGGTCGATCAAAA
vanTE 糖肽类GTGGTGCCAAGGAAGTTGCT CGTAGCCACCGCAAAAAAAT
vanTG 糖肽类CGTGTAGCCGTTCCGTTCTT CGGCATTACAGGTATATCTGGAAA
vanWB 糖肽类CGGACAAAGATACCCCCTATAAAG AAATAGTAAATTGCTCATCTGGCACAT
vanXA 糖肽类TCGTTGGGACGCTAAATATGC GGACGGTAACCGTCCCATA
vanXB 糖肽类AGGCACAAAATCGAAGATGCTT GGGTATGGCTCATCAATCAACTT
vanYB 糖肽类GGCTAAAGCGGAAGCAGAAA GATATCCACAGCAAGACCAAGCT
vanYD 糖肽类AAGGCGATACCCTGACTGTCA ATTGCCGGACGGAAGCA
vat(A) 链阳霉素B
类
ATGAACGGAGCGAATCATCGG CCATACCGATCCAAACGTCATTTC
vat(E) 链阳霉素B
类
GACCGTCCTACCAGGCGTAA TTGGATTGCCACCGACAATT
vatB 链阳霉素B
类
GCAATTGTTGCTGCGAATTCAG GTGCTGACCAATCCCACCA
vga(A)LC 链阳霉素B GTGAAGATGTCTCGGGTACAATTG GAAATACCAGGATTCCCATGCAC
T/ZNZ 287—2024
22
类
vgaA 链阳霉素B
类
GGAAGCTATAGAGGCGTTTGAATC CCGAAGGTTCAATACTCAATCGAC
vgaB 链阳霉素B
类
TAAAAGAGAATAAGGCGCAAGGA TGTTTAGTAGCATGTTGCATTTTCC